Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TOPBP1Q92547 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms