Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGP1Q92546 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RGP1Q92546 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms