Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC7Q8WUI4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HDAC7Q8WUI4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms