Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX29Q8TEQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX29Q8TEQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms