Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM229BQ8NBD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms