Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF1Q8N6C5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF1Q8N6C5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF1Q8N6C5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms