Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD302Q8IX05 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD302Q8IX05 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms