Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KCNMB4Q86W47 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMB4Q86W47 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms