Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMC6Q7Z403 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms