Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP43Q70EL4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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