Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CASC2Q6XLA1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms