Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ANKRD54Q6NXT1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD54Q6NXT1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms