Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NANOGP8Q6NSW7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NANOGP8Q6NSW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms