Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf53Q5VUE5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms