Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms