Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ODF2Q5BJF6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF2Q5BJF6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms