Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q56UQ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q56UQ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q56UQ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q56UQ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms