Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RFTN2Q52LD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RFTN2Q52LD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms