Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN3Q4LDR2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN3Q4LDR2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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