Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX19Q49B96 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms