Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRY2Q49AN0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRY2Q49AN0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms