Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT24Q2M2I5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT24Q2M2I5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms