Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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