Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ASIC2Q16515 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC2Q16515 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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