Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms