Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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