Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP1Q15431 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP1Q15431 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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