Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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