Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 KALRN-203ENST00000354186 10586 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.49□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 NAA20-205ENST00000480550 1000 ntTSL 57.56□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 NAA20-204ENST00000463154 1036 ntTSL 37.34□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 NAP1L4-219ENST00000531291 572 ntTSL 57.32□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 36
PCBP2Q15366 NAP1L4-216ENST00000528968 587 ntTSL 56.73□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 36
PCBP2Q15366 ZFPM2-210ENST00000524235 574 ntTSL 46.72□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 HBS1L-216ENST00000533274 2102 ntTSL 26.55□□□□□ -1.361e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.361e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.371e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 ZFPM2-205ENST00000520027 594 ntTSL 46.32□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 CYTOR-206ENST00000414030 718 ntTSL 36.18□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 HBS1L-213ENST00000529169 633 ntTSL 36.13□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 CYTOR-214ENST00000629257 323 ntTSL 55.93□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 45.83□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 36
PCBP2Q15366 NAP1L4-217ENST00000529361 555 ntTSL 55.57□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 36
PCBP2Q15366 HDAC8-216ENST00000470998 329 ntTSL 35.57□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 CYTOR-203ENST00000409139 519 ntTSL 35.01□□□□□ -1.611e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 HBS1L-209ENST00000526100 1600 ntTSL 24.64□□□□□ -1.671e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 NUMB-220ENST00000556112 568 ntTSL 44.37□□□□□ -1.711e-8■■■■■ 36
PCBP2Q15366 ZRANB3-207ENST00000474919 611 ntTSL 26.85□□□□□ -1.315e-9■■■■■ 36
PCBP2Q15366 ZRANB3-204ENST00000412849 2572 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.325e-9■■■■■ 36
PCBP2Q15366 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.325e-9■■■■■ 36
PCBP2Q15366 PHC2-212ENST00000493483 760 ntTSL 322.48■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 36
PCBP2Q15366 PHC2-206ENST00000467894 1466 ntTSL 522.06■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 36
PCBP2Q15366 PHC2-211ENST00000486897 547 ntTSL 510.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 36
PCBP2Q15366 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 36
PCBP2Q15366 FBRSL1-206ENST00000542306 1246 ntTSL 519.18■□□□□ 0.661e-9■■■■■ 36
PCBP2Q15366 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -12e-6■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 TCF12-228ENST00000569880 311 ntTSL 55.73□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 220.05■□□□□ 0.86e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-205ENST00000425608 1886 ntTSL 219.26■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 217.95■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 211.6□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 26.02□□□□□ -1.456e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RBM6-214ENST00000464013 397 ntTSL 55.51□□□□□ -1.536e-7■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.55e-8■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 YWHAZ-217ENST00000521328 511 ntTSL 59.43□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-12■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 PER1-205ENST00000578089 830 ntTSL 311.75□□□□□ -0.534e-12■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.544e-12■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 PER1-214ENST00000582719 3677 ntTSL 511.64□□□□□ -0.554e-12■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 GDI1-211ENST00000481304 1014 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.041e-11■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 GDI1-213ENST00000489589 918 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-11■■■■■ 35.9
PCBP2Q15366 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 222.75■■□□□ 1.235e-7■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 320.54■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 519.27■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.055e-8■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.125e-8■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 CSRP1-215ENST00000532313 5239 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 CSRP1-211ENST00000527662 4208 ntTSL 27.71□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 CSRP1-218ENST00000533402 8475 ntTSL 1 (best)7.39□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 PPP3CA-205ENST00000507176 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 PPP3CA-209ENST00000529324 579 ntTSL 37.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 PPP3CA-208ENST00000525819 569 ntTSL 43.66□□□□□ -1.821e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC10.22□□□□□ -0.779e-15■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 LARP1-204ENST00000518297 2630 ntTSL 520.12■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 OGT-208ENST00000472270 689 ntTSL 26.46□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.686e-26■■■■■ 35.8
PCBP2Q15366 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.34e-9■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.324e-9■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 FUT10-209ENST00000520767 1623 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 ZDHHC2-204ENST00000523132 167 ntTSL 55.23□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 LRMDA-210ENST00000593817 221 ntTSL 34.58□□□□□ -1.685e-7■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-207ENST00000480329 919 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-213ENST00000484103 541 ntTSL 1 (best)17.74■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.093e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.083e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-211ENST00000487729 803 ntTSL 515.48■□□□□ 0.073e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-205ENST00000420518 588 ntTSL 315.12■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-208ENST00000481809 872 ntTSL 514.94□□□□□ -0.023e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-10■■■■■ 35.7
PCBP2Q15366 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.093e-10■■■■■ 35.7
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