Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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