Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMCO1Q147U7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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