Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRCAPQ14761 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms