Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CKAP5Q14008 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CKAP5Q14008 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CKAP5Q14008 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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CKAP5Q14008 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CKAP5Q14008 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CKAP5Q14008 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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