Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LSAMPQ13449 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LSAMPQ13449 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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