Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA4Q13439 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA4Q13439 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA4Q13439 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA4Q13439 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA4Q13439 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA4Q13439 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GOLGA4Q13439 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms