Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XRCC4Q13426 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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