Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGB3BPQ13352 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGB3BPQ13352 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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