Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA3BQ13214 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms