Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX10Q13206 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX10Q13206 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
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