Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLFQ13129 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLFQ13129 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLFQ13129 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RLFQ13129 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLFQ13129 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RLFQ13129 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RLFQ13129 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms