Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
STX4Q12846 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
STX4Q12846 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STX4Q12846 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
STX4Q12846 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STX4Q12846 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
STX4Q12846 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms