Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNMA1Q12791 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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