Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
HMGXB3Q12766 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HMGXB3Q12766 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
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