Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4F3Q08477 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4F3Q08477 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms