Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB2Q08289 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms