Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRNDQ07001 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms