Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PITX1P78337 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PITX1P78337 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PITX1P78337 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms