Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAV3P56539 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CAV3P56539 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CAV3P56539 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAV3P56539 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CAV3P56539 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CAV3P56539 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CAV3P56539 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CAV3P56539 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms