Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NAP1L1P55209 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms