Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCPP55072 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCPP55072 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCPP55072 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCPP55072 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCPP55072 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPP55072 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPP55072 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPP55072 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPP55072 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPP55072 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPP55072 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPP55072 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPP55072 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPP55072 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPP55072 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPP55072 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms